=
;
=
249;#›
1. týden <= span style=3D'font-size:83%'>6.10. - 10.10.2008
=
=
•OPAKOVÁNÍ
•
•Úvod do
POPULAČNÍ
GENETIKY
![](3D"slide0001_image002.gif")
1
Informace o výuce (v&yacu=
te;věska)
- nahrazování (zcela výjimečně)
- podmínky udělení zápočtu (docházka, prospěch z testů 16/24, 18/26, 14/20)
- zkouška (písemný test, ústní)=
- termíny (předtermíny, řádné, opravné - IS)
- nahrazování (zcela výjimečně)
- podmínky udělení zápočtu (docházka, prospěch z testů 16/24, 18/26, 14/20)
- zkouška (písemný test, ústní)=
- termíny (předtermíny, řádné, opravné - IS)
=
=
technická asistent=
ka výuky
paní Milena Novotná
plná kompetence v oblasti výuky -
dotazy, shromažďování
písemných žádostí (např. o trval&yac=
ute;
přesun praktik),
ztráty a nálezy aj.
2
VYBRANÉ PŘÍKLADY letního semestru
=
=
•1.
Nondisjunkce u Downova, Turnerova a Klinefelterova syndromu
•2.
Hodnocení karyotypu s aberací
•3. Vazb=
a
•
•
•
•4. Odhady genových frekvencí
3
Úvod do
POPULAČNÍ GENETIKY
POPULAČNÍ GENETIKY
![](3D"slide0072_image004.gif")
1. Nondisjunkce u Downov=
a, Turnerova a Klinefelterova
syndromu
=
=
•Úkol 17e, a, b/str. =
45 Kot=
(toto pořadí dodržte)
•Zbylé c) a d=
) - sy tří X a supermale -k dokon=
čení
doma jako samostudium!
•
•Pozn.: T=
ext
požaduje, stejně jako je tomu v předrigorózním testu,
všechny možnosti v=
zniku
jednotlivých syndromů.
4
![](3D"slide0081_image005.gif")
Disjunkce chromosomů v meióze
- obecné
schéma
normální gameta
![](3D"slide0081_image008.gif")
![](3D"slide0081_image009.gif")
=
zygota
![](3D"slide0081_image010.gif")
![](3D"slide0081_image011.gif")
normální gameta druhého
rodiče
č. č.
nebo XX nebo XY
nebo XX nebo XY
č.<=
/div>
č.<=
/div>
č.<=
/div>
Normální karyotyp
Zárodečná
buňka
(pár chromosomů)
(pár chromosomů)
Po meióze I
(jeden chromosom)
(jeden chromosom)
Po meióze II
(monochromatidový chromozóm)
(monochromatidový chromozóm)
č.<=
/div>
=
č.
č.
Chromatidová
disjunkce
ve
II. meiotickém dělení
č.<=
/div>
č.<=
/div>
č.<=
/div>
č.<=
/div>
Chromosomální
disjunkce
v
I. meiotickém dělení
![](3D"slide0081_image012.gif")
5
Obecné schéma nondisjunkce<=
br>
(postup,
příklad)
![](3D"slide0091_image013.gif")
aberantní gameta
=
zygota
normální gameta druhého
rodiče (monosomická)<=
/div>
č. č.
nebo XX nebo XY
nebo XX nebo XY
č.<=
/div>
č.<=
/div>
č. č.=
cytogenetická diagnóza=
Zárodečná
buňka
(pár chromosomů)
(pár chromosomů)
Po meióze I
(jeden chromosom)
(jeden chromosom)
Po meióze II
(monochromatidový chromosom)
(monochromatidový chromosom)
č.<=
/div>
=
č.
č. č.
![](3D"slide0091_image014.gif")
Nondisjunkce
ve II.
meiotickém dělení
č. č.=
č.<=
/div>
č.<=
/div>
6
![](3D"slide0082_image015.gif")
<=
span
style=3D'font-size:63%'>17e) Schéma vzniku
Downova syndromu (prostá trisomie) za p=
ředpokladu, že
k nondisjunkci došlo v meióze
I
u jednoho z rodi= čů
k nondisjunkci došlo
u jednoho z rodi= čů
47,XX,+21=
47,XY,+21
![](3D"slide0082_image016.gif")
aberantní
gameta
zygota
normální
gameta druhého rodi=
69;e
(monosomická)
21 21
21 21
21 21
21 21
21 21 21
21
21 21
7
Nondisjunkce
v I. meiotickém dělení
17e) Schéma vzniku
Downova syndromu =
(prostá trisomie) za p=
ředpokladu,
v meióze
II
u jednoho
z rodi= čů
v meió
u jednoho
z rodi= čů
![](3D"slide0092_image017.gif")
aberantní
gameta
zygota
normální
gameta druhého rodi=
69;e
(monosomická)
21 21
21
21
21 21
21 21
21 21 21
21
21
21
![](3D"slide0092_image018.gif")
47,XX,+21=
47,XY,+21
![](3D"slide0092_image019.gif")
8
Nondisjunkce
ve II.
meiotickém dělení
=
17a) Schéma vzniku
Turnerova syndromu za předpokladu, že k nondisjunkci
došlo v meioze I u otce
došlo v meioze I u otce
![](3D"slide0074_image020.gif")
aberantní
gameta
zygota
normální
gameta matky (monosomická)
X Y
X Y
X Y
X
X
45,X
X Y
![](3D"slide0074_image021.gif")
9
Nondisjunkce
v I. meiotickém dělení
=
17a) Schéma vzniku
Turnerova syndromu za předpokladu, že k nondisjunkci
došlo v meioze I u matky
došlo v meioze I u matky
![](3D"slide0075_image022.gif")
aberantní
gameta
zygota
normální
gameta otce (monosomická)
X X
X X
X X
X
X
45,X
X X
![](3D"slide0075_image023.gif")
10
Nondisjunkce
v I. meiotickém dělení
![](3D"slide0076_image024.gif")
<=
span
lang=3DCS style=3D'font-size:63%;mso-fareast-language:ZH-CN'>17a) Schéma vzniku
Turnerova syndromu za předpokladu, že k nondisjunkci
došlo v meioze II u otce
došlo v meioze II u otce
11
![](3D"slide0076_image025.gif")
X
Y Y
X
aberantní
gameta
zygota
normální
gameta matky (monosomická)
X Y
X
Y
X
X
45,X
X X
Y
Y
!!
nebo:
Nondisjunkce
ve II.
meiotickém dělení
![](3D"slide0076_image026.gif")
![](3D"slide0076_image027.gif")
![](3D"slide0076_image028.gif")
![](3D"slide0076_image029.gif")
![](3D"slide0076_image030.gif")
<=
span
lang=3DCS style=3D'font-size:63%;mso-fareast-language:ZH-CN'>17a) Schéma vzniku
Turnerova syndromu za předpokladu, že k nondisjunkci
došlo v me=
ioze
II u matky
![](3D"slide0078_image031.gif")
aberantní
gameta
zygota
normální
gameta otce (monosomická)
X X
X
X
X
X
X
X X
45,X
X
![](3D"slide0078_image032.gif")
12
Nondisjunkce
ve II. meiotickém dělení
![](3D"slide0079_image033.gif")
17b) Schéma vzniku
Klinefelterova syndromu za předpokladu, že k nondisjunkci<=
br>
došlo v meioze I u otce
aberantní
gameta
![](3D"slide0079_image034.gif")
![](3D"slide0079_image035.gif")
zygota
![](3D"slide0079_image036.gif")
![](3D"slide0079_image037.gif")
![](3D"slide0079_image038.gif")
normální
gameta matky (monosomická)
X Y
X Y
X Y
X Y
X X Y
X
47,XXY
X Y
13
Nondisjunkce
v I. meiotickém dělení
![](3D"slide0077_image039.gif")
X X
=
aberantní
gameta
zygota
normální
gameta otce (monosomická)
X X
X X
X X
X X Y
Y
47,XXY
X X
17b) Schéma vzniku
Klinefelterova syndromu za předpokladu, že k nondisjunkci =
došlo <=
/span>v meioze
I u ma=
tky
![](3D"slide0077_image040.gif")
14
Nondisjunkce
v I. meiotickém dělení
17b) Schéma vzniku
Klinefelterova syndromu za předpokladu, že k nondisjunkci =
došlo <=
/span>v meioze
II u matky
![](3D"slide0080_image041.gif")
![](3D"slide0080_image042.gif")
ve II. meiotickém dělení=
------=_NextPart_01C945D8.A2124A90
Content-Location: file:///C:/2B3A5638/opak2r1t08_soubory/slide0080.xml
Content-Transfer-Encoding: quoted-printable
Content-Type: text/xml; charset="utf-8"
X X
X
X
aberantní
gameta
zygota
normální
gameta otce (monosomická)
X X
X
X
X X
X X Y
Y
47,XXY
15
Nondisjunkce
ve II. meiotickém dělení=
2.
Hodnocení karyotypu s aberací
=
=
•a) úkol 7/str. 41 Kot
•b) úkol 11/str. 42 Kot
•c) =
segregace chromosomů do gamet
•d) =
celkové shrnut&i=
acute;
m. Down
![3D"HM00363_"](3D"slide0015_image044.gif")
16
=
=
• - celkov&ya=
cute;
počet chromosomů (46, 45, 47, jiný)
• -
heterochromosomální komplement (XX, XY, jiný)
- nadbytečné chromosomy (trisomie=
, markery)
17
![3Dxok](3D"slide0017_image046.gif")
![](3D"slide0017_image047.gif")
18
Rozdíl mezi cytogenetickou a klinickou diagnózou
![=3Dxok](3D"slide0099_image048.gif")
![](3D"slide0099_image049.gif")
19
![](3D"slide0099_image050.gif")
Klinic=
ká
diagnóza
![](3D"slide0099_image051.gif")
Cytoge=
netická
diagnóza
![](3D"slide0099_image052.gif")
![](3D"slide0099_image053.gif")
![](3D"slide0099_image054.gif")
Nikoliv všichni jedinci mající
příznaky (symptomy) určitého (zde např.
Turnerova) syndromu musejí mít stejný
cytogenetický nález (zápis, diagnózu).
Avšak všichni jedinci
sdílející stejnou =
cytogenetickou diagnózu obv=
ykle
mají stejný komplexní fenotyp (syndrom, chorobu).
![](3D"slide0099_image055.gif")
![](3D"slide0099_image056.gif")
![](3D"slide0099_image057.gif")
![](3D"slide0083_image059.gif")
![](3D"slide0083_image060.gif")
![](3D"slide0083_image061.gif")
zápis dle ISCN 1995=
: 45,XY,der(14;21)
<=
/b>
zápis dle ISCN 2005:=
45,XY,rob(14;21)
![](3D"slide0083_image062.gif")
=
Řešení: <=
/i>nositel
balancované translokace 14;21<=
span
style=3D'font-size:74%;mso-special-format:lastCR;display:none'>
20
![](3D"slide0084_image063.gif")
45,XY,rob(14;21)
![](3D"slide0084_image064.gif")
![](3D"slide0084_image065.gif")
![](3D"slide0084_image066.gif")
![](3D"slide0084_image067.gif")
![](3D"slide0084_image074.gif")
21
![](3D"slide0084_image075.gif")
14
![](3D"slide0084_image076.gif")
![](3D"slide0084_image077.gif")
14<=
/div>
21<=
/div>
14<=
/div>
21<=
/div>
21<=
/div>
21<=
/div>
14<=
/div>
14<=
/div>
14<=
/div>
14<=
/div>
21<=
/div>
21<=
/div>
![](3D"slide0084_image079.gif")
NORMA
![](3D"slide0084_image080.gif")
![](3D"slide0084_image081.gif")
M.DOWN
33,3%
LETÁLNÍ
BALANCOVANÁ
TRANSLOKACE
14<=
/div>
21<=
/div>
![](3D"slide0084_image082.gif")
c) segregace chromosomů do gamet
u předchozího jedince
u předchozího jedince
21
![](3D"slide0085_image083.gif")
MORBUS DOWN
PROBAND<=
span
lang=3DEN-GB style=3D'font-family:Arial;mso-ascii-font-family:Arial;mso-ha=
nsi-font-family:
Arial;font-size:74%;color:yellow;mso-color-index:3'>
RODIČE
RIZIKO
47,XX/Y,+21
46,XX/Y
46,XX/Y
> než<=
span
lang=3DEN-GB style=3D'font-family:Arial;mso-ascii-font-family:Arial;mso-bi=
di-font-family:
"Times New Roman";mso-hansi-font-family:Arial;font-size:50%;color:yellow;
mso-color-index:3'> populační
závisí na <=
/b>vě<=
span
lang=3DEN-GB style=3D'font-family:Arial;mso-ascii-font-family:Arial;mso-bi=
di-font-family:
"Times New Roman";mso-hansi-font-family:Arial;font-size:50%;color:yellow;
mso-color-index:3'>ku matky
46,XX/Y,der(21;21),+21
45,XX/Y ,der(2=
1;21)
46,XX/Y
100% TEORETICKÉ=
3;
100% EMPIRICKÉ=
46,XX/Y,der(D;21),+21
46,XX/Y+21,der(21;22)
45,XX/Y ,der(D;21)
45,XX/Y ,der(2=
1;22)
46,XX/Y
33,3% TEORETICKÉ &=
#13;
EMPIRICKÉ:
cca 5% - nositel otec
cca 15% - nositelka matka
46,XX/Y,der(D;21),+21
46,XX/Y,+21,der(21;G)
46,XX/Y
46,XX/Y
NOVÁ MUTACE
NONPATERNITA
47,XX/Y,+21
47,XX/Y,+21/46,XX/Y
46,XX/Y
MOZAIKA –
závisí na zastoupení linií aberovaných a normálních buněk=
=
=
d) ú=
kol
18, str. 45 Kot - shrnutí m. Down (předpokládané
chromosomální nálezy u rodičů a rizika
opakování v závislosti na nálezu u
postiženého)
22
3. Vazba
=
=
•a) úkol 4/str. 54 Kot - zpětné
křížení ve fázi trans, =
tvorba gamet a zastoupení fenotypů
•b) úkol 19/str. 61 Kot – vazba v rodokmenu (sy
nail-patella)
23
Demonst=
race:
zpětné křížení ve fázi trans (odpovíd&aacut= e; úkolu 4/str. 54 Kot) , opakov&=
aacute;ní
tvorby gamet
a zastoupení fenotypů
zpětné křížení ve fázi trans (odpovíd&aacut= e; úkolu 4/str. 54 Kot
24
![](3D"slide0023_image085.gif")
![](3D"slide0037_image087.gif")
<=
![endif]>25
![](3D"slide0041_image089.gif")
26
![](3D"slide0026_image091.gif")
2=
7
![](3D"slide0024_image092.gif")
00<=
b>
B0
B0
B0
B0<=
b>
B0<=
b>
B0<=
b>
B0<=
b>
B0<=
b>
B0<=
b>
B0<=
b>
00<=
b>
00<=
b>
00<=
b>
00<=
b>
00<=
b>
00<=
b>
A0<=
b>
A0<=
b>
A0<=
b>
I<=
b>
II<=
b>
III<=
span
style=3D'font-size:35%;color:yellow;mso-special-format:lastCR;display:none=
'>
obr. č. VI=
I/2
28
![](3D"slide0088_image094.gif")
NPS<=
span
style=3D'font-family:Arial;mso-ascii-font-family:Arial;mso-hansi-font-fami=
ly:
Arial;font-size:37%;color:yellow;position:relative;top:-.45em;mso-text-rai=
se:
30%'>+
0
B
NPS<=
span
style=3D'font-family:Arial;mso-ascii-font-family:Arial;mso-hansi-font-fami=
ly:
Arial;font-size:37%;color:yellow;position:relative;top:-.45em;mso-text-rai=
se:
30%'>mut
![](3D"slide0088_image095.gif")
NPS<=
span
style=3D'font-family:Arial;mso-ascii-font-family:Arial;mso-hansi-font-fami=
ly:
Arial;font-size:37%;color:yellow;position:relative;top:-.45em;mso-text-rai=
se:
30%'>+
0
0
NPS<=
span
style=3D'font-family:Arial;mso-ascii-font-family:Arial;mso-hansi-font-fami=
ly:
Arial;font-size:37%;color:yellow;position:relative;top:-.45em;mso-text-rai=
se:
30%'>+
![](3D"slide0088_image096.gif")
NPS<=
span
style=3D'font-family:Arial;mso-ascii-font-family:Arial;mso-hansi-font-fami=
ly:
Arial;font-size:37%;color:yellow;position:relative;top:-.45em;mso-text-rai=
se:
30%'>+
NPS<=
span
style=3D'font-family:Arial;mso-ascii-font-family:Arial;mso-hansi-font-fami=
ly:
Arial;font-size:37%;color:yellow;position:relative;top:-.45em;mso-text-rai=
se:
30%'>+
0
B
![](3D"slide0088_image097.gif")
00<=
b>
B0<=
b>
B0
B0<=
b>
B0<=
b>
B0<=
b>
B0<=
b>
B0<=
b>
B0<=
b>
B0<=
b>
B0<=
b>
00<=
b>
00<=
b>
00<=
b>
00<=
b>
00<=
b>
00<=
b>
A0<=
b>
A0<=
b>
A0<=
b>
I<=
b>
II<=
b>
III<=
span
style=3D'font-size:35%;color:yellow;mso-special-format:lastCR;display:none=
'>
obr. č. VI=
I/2
![](3D"slide0088_image098.gif")
NPS<=
span
style=3D'font-family:Arial;mso-ascii-font-family:Arial;mso-hansi-font-fami=
ly:
Arial;font-size:37%;color:yellow;position:relative;top:-.45em;mso-text-rai=
se:
30%'>+
0
0
NPS<=
span
style=3D'font-family:Arial;mso-ascii-font-family:Arial;mso-hansi-font-fami=
ly:
Arial;font-size:37%;color:yellow;position:relative;top:-.45em;mso-text-rai=
se:
30%'>mut
![](3D"slide0088_image099.gif")
![](3D"slide0088_image100.gif")
![](3D"slide0088_image101.gif")
![](3D"slide0088_image102.gif")
![](3D"slide0088_image103.gif")
![](3D"slide0088_image104.gif")
![](3D"slide0088_image105.gif")
![](3D"slide0088_image106.gif")
![](3D"slide0088_image107.gif")
![](3D"slide0088_image108.gif")
![](3D"slide0088_image109.gif")
29
Odpovědi:
=
=
a)AD (alely označme např. NPSmu=
t a NP=
S+<=
/span>),
•b) ano (pozn.: lokalizace dnes známa, 9q34),
•c)
homologní chromosomy (haplotypy) u dědečka =
<=
span
style=3D'mso-tab-count:1;width:4.16%'> I/1
jsou 0 NPS+ / 0 NPS+ a u
babičky I/2 jsou <=
span
style=3D'mso-tab-count:1;width:4.58%'> B
NPSmut / 0 NPS+,
•d) rekombina=
ce
je u synů II/5, II/8 a II/14 a vnučky <=
span
style=3D'mso-tab-count:1;width:4.58%'> III/3,
•e)
rekombinační zlomek je 4/16 =3D 0,25, tj. 25 % <=
span
style=3D'position:absolute;top:31.14%;left:5.29%;width:94.88%;height:37.7%=
'><=
span
style=3D'mso-tab-count:1;width:3.86%'> rekombinací =
(pozn.:
současné odhady mapové <=
span
style=3D'mso-tab-count:1;width:4.58%'> vzdálenosti 1,5 ̵=
1; 3
cM),
•f) ano ̵=
1;
rekombinace u III/3 vznikla při meioze u <=
span
style=3D'mso-tab-count:1;width:4.58%'> muže
II/3.
30
![](3D"slide0087_image110.gif")
00
B0
B0
B0
B0
B0
B0
B0
B0
B0
B0
00
00
00
00
00
00
A0
A0
A0
I
II
III
obr. č. VII/2
NPS+
0
B
NPSmut
NPS+
0
0
NPS+
NPS+
NPS+
0
B
NPS+
0
0
NPSmut
31
4. Úvod do populační
genetiky
– odhady genových frekvenc&i= acute;
– odhady genových frekvenc&i= acute;
=
=
a) úkol č. 5/str. 101 Kot –
frekvence alel systému M=
N
b) úkol č. 9/str. 102 Kot – odha=
dy
frekvencí než&aac=
ute;doucích
(recesívních) alel
c) úkol
č. 6/str. 101 Kot (rozdíly ve frekvencích genů pro jednotlivá etnika)
Přednáška byla
v minulém semestru
krátký text na str. 99 Kot
rovnice 3/ a 4/ na str. 100 dole a 101 nahoře= .
krátký text na str. 99 Kot
rovnice 3/ a 4/ na str. 100 dole a 101 nahoře= .
32
![](3D"slide0093_image111.gif")
1
2
2
)
(
)
(
2
)
(
aa
Aa
AA
q
pq
p
<=
span
style=3D'position:absolute;top:9.21%;left:8.42%;width:83.14%;height:8.13%'=
>Castle-Hardy-Weinbergova zákonitost
=
=
•platí v panmiktické populaci=
za předpokladu
omezujících podmínek
33
=
=
•základní vztah pro
systém se dvěma alelami sledovaného genu<=
/span>
![](3D"slide0094_image112.gif")
1
)
(
)
(
a
A
q
p
<=
span
style=3D'position:absolute;top:3.79%;left:8.42%;width:83.14%;height:8.13%'=
>Castle-Hardy-Weinbergova zákonitost
![](3D"slide0094_image113.gif")
)
(
a
q
1
)
(
A
p
aproximace
1
![](3D"slide0094_image114.gif")
)
(
A
p
2
)
(
Aa
pq
q
2
, když
se blíží
.
34
![](3D"slide0029_image115.gif")
úkol č. 5/str. 101 Kot
– frekvence alel systému MN
– frekvence alel systému MN
Fenotyp<=
/div>
Počet osob=
M
406
MN
744
N
332
35
36
úkol č. 5/str. 101 Kot
– frekvence alel systému MN
– frekvence alel systému MN
=
=
Řešení:
![](3D"slide0095_image116.gif")
vzorku
<=
/b>
jedinců
ve
h
počet
všec
2
)
(
tů
heterozygo
počet
)
(
homozygotů
počet
2
´=
+
´=
=3D
Aa
AA
p(A)
36
úkol č. 5/str. 101 Kot
– frekvence alel systému MN
– frekvence alel systému MN
![](3D"slide0096_image117.gif")
0
744
812
alel M
![](3D"slide0096_image118.gif")
1 556
1 408
![](3D"slide0096_image119.gif")
1 482
Celkem
![](3D"slide0096_image120.gif")
664
744
0
alel N
![](3D"slide0096_image121.gif")
332
N
744
406
osob
Počet
MN
M
Fenotyp<=
/div>
![](3D"slide0096_image122.gif")
![](3D"slide0096_image123.gif")
![](3D"slide0096_image124.gif")
![](3D"slide0096_image125.gif")
![](3D"slide0096_image127.gif")
![](3D"slide0096_image129.gif")
37
![](3D"slide0031_image130.gif")
úkol č. 9/str. =
102 Kot
– odhady frekvencí nežádoucích (recesívních)= alel
– odhady frekvencí nežádoucích (recesívních)= alel
choroba<=
/div>
zkratka<=
/div>
výskyt
v populaci
fenylketonurie<=
/span>
PKU
1/8100
cystická
fibróza (mukoviscidóza)
CF
1/2500
38
![](3D"slide0097_image131.gif")
úkol č. 9/str. =
102 Kot
– odhady frekvencí nežádoucích (recesívních)= alel
– odhady frekvencí nežádoucích (recesívních)= alel
=
=
•Řešen&iac=
ute;:
odhad vypočten podle vzorce 4/ st=
r.
101 Kot (nahoře),=
39
populaci
v
frekvence
vzorku
ve
osob
počet
všech
homozygotů
recesivních
počet
=3D
=3D
=3D
q
![](3D"slide0098_image132.gif")
<=
span
style=3D'position:absolute;top:4.6%;left:.18%;width:100.0%;height:7.31%'><=
span
style=3D'font-size:74%;mso-ansi-language:1024'>úkol č. 9/str. =
102 Kot – odhady frekvenc&ia=
cute; nežádoucí=
;ch
(recesívních) alel
odhad
49/50 =3D 1
89/90 =3D 1
p =3D 1 =
-
q
1/50
1/90
q
1/2500
1/8100
výskyt
v populaci=
CF
PKU
choroba<=
/div>
2=
pq
=3D 2q
2 x 1 x 1/50